モデルと一緒にテクスチャ編集用のPSDファイルが配布されているのでモデルと一緒にDLしましょう。
モデルはUnityPackageとして配布されていますので、
概要編に従って読み込みます。
出来上がったプロジェクトファイルのフォルダを見てください。
例:mikoko¥Assets¥Mikoko¥MikokoTex.bmp
このbmpファイルがMikokoモデルで使われているテクスチャファイルです。
DLしたPSDファイルを好みの色やデザインに変更し、BMP形式で書き出したらこのファイルに上書きします。
GIMPで初期設定のままBMPファイルを書き出すとUnity上で読み込めないそうなので、書き出し時のオプションを見直すか、別のペイントソフトで編集するか、一端MSペイントなどで保存しなおす等で対処してください。